Les médecins sont invités à considérer les infections fongiques comme une cause possible d’inflammation pulmonaire : le changement climatique étend la propagation de la fièvre de la vallée, d’autres maladies fongiques au-delà des points chauds typiques

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L’expert en maladies infectieuses George Thompson étudie et traite les maladies fongiques depuis plus de deux décennies. Il surveille leur propagation, les symptômes et les risques relatifs. Dernièrement, il s’est davantage inquiété d’une menace croissante : la propagation de champignons pathogènes en dehors de leurs points chauds traditionnels.

Dans un commentaire publié dans Annales de médecine interne, Thompson et son co-auteur de la branche des maladies mycotiques des Centers for Disease Control and Prevention Tom Chiller ont sonné l’alarme. Ils ont noté la présence croissante et les risques émergents de trois maladies fongiques endémiques : l’histoplasmose, la blastomycose et la coccidioïdomycose (fièvre de la vallée).

« Ces trois maladies fongiques habitent généralement des régions américaines spécifiques propices à leur survie », a déclaré Thompson. Il est professeur à la faculté de médecine de l’UC Davis au département de médecine interne, division des maladies infectieuses et au département de microbiologie médicale et d’immunologie. « Récemment, nous avons trouvé plus de cas de ces maladies en dehors de leurs zones connues, prenant les cliniciens et les patients par surprise. »

Les infections fongiques sont une menace mondiale émergente

Les champignons sont des micro-organismes que l’on trouve en abondance dans la nature. Ils comprennent les levures, les moisissures, les champignons et plus encore. Alors que la plupart des champignons sont inoffensifs pour l’homme, certains peuvent provoquer des maladies (appelées mycoses) qui pourraient faire des ravages sur les patients et le système de santé.

Récemment, l’Organisation mondiale de la santé (OMS) a publié sa liste des pathogènes fongiques prioritaires, identifiant les champignons les plus préoccupants qui peuvent provoquer des infections pour lesquelles il existe une résistance aux médicaments ou d’autres problèmes de traitement. Ces agents pathogènes devraient entraîner encore plus de problèmes au cours de la prochaine décennie.

Le changement climatique augmente la propagation des infections fongiques

Les champignons endémiques ont traditionnellement eu des distributions géographiques distinctes. Les changements climatiques de température et de pluie affectent l’endroit où ces champignons se développent.

Les auteurs ont noté les régions en expansion abritant les champignons endémiques. La fièvre de la vallée, par exemple, a été trouvée dans le Nebraska, bien à l’est de ses points chauds traditionnels en Californie et en Arizona.

« Les organismes sont probablement beaucoup plus répandus que nous ne le pensions à l’origine. Il est de plus en plus probable que les cliniciens qui ne sont pas familiers avec ces organismes les rencontreront au cours de leur pratique quotidienne », a déclaré Thompson.

Les cliniciens manquent souvent le diagnostic d’infection fongique

Les trois mycoses endémiques présentent de nombreux symptômes, notamment de la fièvre, des frissons, de la toux, des sueurs nocturnes et de la fatigue. Ils peuvent également provoquer des infections pulmonaires qui imitent la pneumonie. En tant que tels, ils peuvent facilement être confondus avec des infections pulmonaires virales et bactériennes plus courantes.

Les directives actuelles sur la pneumonie de l’American Thoracic Society et de l’Infectious Diseases Society of America n’offrent pas de tests spécifiques ou de recommandations de traitement pour la mycose endémique. La plupart des praticiens peuvent avoir peu d’expérience dans la reconnaissance et le traitement de ces infections pulmonaires fongiques.

Environ 20 % des cas de pneumonie dans certaines parties de la Californie et de l’Arizona sont causés par la fièvre de la Vallée. Pourtant, il faut généralement plus de trois semaines après le début des symptômes pour obtenir le bon diagnostic. Le diagnostic d’histoplasmose et de blastomycose peut prendre encore plus de temps.

Les infections fongiques sont également souvent diagnostiquées à tort comme bactériennes. Lorsque ce diagnostic erroné se produit, le patient se voit prescrire des antibiotiques inefficaces pour les maladies fongiques. Cela les expose également à des médicaments inutiles et contribue à l’augmentation de la résistance aux antimicrobiens dans la communauté. Les auteurs ont exhorté les médecins à prendre des antécédents de voyage complets et à effectuer davantage de tests pour exclure une infection fongique avant de donner aux patients une deuxième série d’antibiotiques.

« Dans les régions où ces maladies fongiques fleurissent, les médecins doivent envisager le diagnostic et le dépistage des mycoses chez tous les patients atteints d’une maladie évocatrice », a recommandé Thompson.

Les auteurs ont identifié plusieurs facteurs qui pourraient contribuer à ces retards de diagnostic et de traitement. L’un est la variation des connaissances des cliniciens sur le diagnostic et la prise en charge des maladies. Un autre est le manque de diagnostics au point de service. Les panels habituellement utilisés pour le diagnostic des infections respiratoires n’incluent pas les mycoses endémiques. Les tests d’anticorps sériques et d’antigènes urinaires pour les mycoses endémiques ne sont généralement disponibles que dans certains laboratoires.

Plan d’action pour faire face aux mycoses endémiques

Les auteurs voient une opportunité d’améliorer les pratiques de diagnostic et de traitement fongiques grâce à une meilleure surveillance et à une formation médicale continue sur ces infections régionales. Ils ont suggéré une approche à multiples facettes pour aider les efforts de prévention et la reconnaissance et le traitement en temps opportun de ces maladies. Ils ont réclamé :

1) surveillance nationale et notification des mycoses endémiques chez les humains et les animaux

2) efforts éducatifs pour les patients et les fournisseurs

3) inclusion des mycoses endémiques dans les futures lignes directrices sur la pneumonie

4) développement d’outils de diagnostic au point de service

5) exploration d’un vaccin pan-endémique contre les mycoses pour prévenir l’infection

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