Une tendance croissante à l’évasion des anticorps par de nouvelles sous-variantes d’omicron : une étude montre 3 variantes qui résistent à l’immunité

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Trois sous-variantes omicron actuellement en circulation du SRAS-CoV-2 – dont deux qui représentent actuellement près de 50 % des infections au COVID-19 signalées aux États-Unis – sont plus efficaces pour échapper aux anticorps neutralisants générés par les vaccins et les infections que les versions antérieures d’omicron , de nouvelles recherches suggèrent.

Les scientifiques ont testé des anticorps neutralisants dans des échantillons de sérum sanguin de professionnels de la santé vaccinés et ayant reçu un rappel ou récemment infectés contre plusieurs sous-variantes en circulation. Trois sous-variants se sont démarqués par leur résistance à la réponse immunitaire anticorps : BQ.1, BQ.1.1 et BA.2.75.2.

Selon les Centers for Disease Control and Prévention (CDC). BA.2.75.2, un mutant de la variante BA.2 omicron, était la meilleure de toutes les variantes testées pour éviter les anticorps neutralisants, mais ne représente actuellement qu’une très petite proportion des maladies signalées aux États-Unis.

« En général, les sous-variantes BQ.1 et BQ.1.1 sont bien meilleures que les variantes précédentes pour échapper à la réponse des anticorps médiés par le rappel – les titres d’anticorps neutralisants sont clairement beaucoup plus faibles. Et ces deux variantes deviennent dominantes », a déclaré Shan -Lu Liu, auteur principal de l’étude et professeur de virologie au Département des biosciences vétérinaires de l’Ohio State University.

« Il est important d’être conscient lors des voyages et des rassemblements pendant les vacances que les variantes du SRAS-CoV-2 continuent d’évoluer », a déclaré Liu, également professeur au Département d’infection et d’immunité microbiennes. « Si vous avez été vacciné avec le premier rappel il y a plus de six mois, vous pourriez envisager de recevoir un deuxième rappel car les anticorps d’un seul rappel sont maintenant probablement trop faibles pour être protecteurs. »

L’étude est publiée aujourd’hui dans la revue Hôte cellulaire et microbe.

Bien que le troisième rappel, une formulation bivalente mise à jour, soit maintenant administré à ceux qui sont éligibles, plus de 48% de la population totale éligible au rappel n’a pas encore reçu de dose de rappel, selon les données du CDC. Le laboratoire de Liu a précédemment montré qu’une injection de rappel COVID-19 fournissait une protection d’anticorps forte et large contre une gamme de variantes de la sous-lignée omicron, et qu’un deuxième rappel rétablissait le nombre d’anticorps décroissants à des niveaux protecteurs.

Pour la présente étude, les échantillons de sérum provenaient de professionnels de la santé qui avaient reçu deux doses de vaccin à ARNm et un rappel ou qui avaient été infectés au cours d’une onde omicron précoce ou tardive.

Les résultats ont montré une diminution d’environ 20 fois des vaccins et des anticorps générés par un rappel unique qui pourraient neutraliser BQ.1 et BQ.1.1 par rapport aux anticorps neutralisants contre le virus SARS-CoV-2 d’origine, ou parent. De même, les niveaux d’anticorps neutralisants, ou titres, générés par l’infection au cours de l’onde BA.1 omicron étaient significativement plus faibles contre les sous-variants BQ que contre le virus parental, et les titres d’anticorps contre les sous-variants BQ générés par l’infection au cours de l’onde BA.4/5 n’a pas atteint le niveau de détection.

« Nos résultats suggèrent que vous ne pouvez pas compter sur une infection naturelle pour vous protéger contre les sous-variantes omicron actuellement en circulation », a déclaré Liu, également directeur associé du Center for Retrovirus Research de l’Ohio State et codirecteur du programme Viruses and Emerging Pathogens dans l’Ohio State. Institut des maladies infectieuses.

Liu et ses collègues ont mené des études de culture cellulaire à l’aide de pseudovirus – un noyau viral non infectieux entouré de différentes protéines de pointe du SRAS-CoV-2 à la surface structurées pour correspondre aux variantes connues. La méthode utilisée pour détecter les anticorps neutralisants dans les échantillons de sang tient compte des niveaux variables d’anticorps produits par les individus.

Dans cette étude, le collaborateur et co-auteur de l’Ohio State, Kai Xu, a créé des modèles structurels d’acides aminés individuels modifiés par les mutations les plus récentes sur la protéine de pointe, identifiant quelques molécules clés que les sous-variantes ont réarrangées afin qu’elles puissent empêcher les anticorps de se lier au virus. particules. Cette modélisation a montré que l’un de ces acides aminés, appelé N460K, permet également aux particules BQ.1 et BQ.1.1 de pénétrer plus efficacement dans les cellules hôtes et de forcer les cellules hôtes à fusionner, une étape de l’infection virale qui peut augmenter la pathogenèse — ce qui contribue à l’apparition de la maladie, à sa progression vers des symptômes plus graves et à la transmissibilité de la maladie.

« De mon point de vue, cela est préoccupant car la variante originale de l’omicron n’était pas très pathogène – elle n’a pas du tout provoqué de fusion cellulaire », a déclaré Liu. « Mais nous voyons maintenant une tendance avec ces nouvelles sous-variantes de fusion cellulaire accrue, et cette tendance place le virus dans une meilleure position pour provoquer une infection et une pathogenèse. »

D’autres études de laboratoires sur la production d’anticorps neutralisants du rappel bivalent suggèrent que le rappel mis à jour offrirait une protection contre les nouvelles sous-variantes d’omicron, a déclaré Liu.

Mais Liu a soumis un article pour publication sur une autre sous-variante appelée XBB, une variante recombinante créée par l’échange de matériel génétique entre deux sous-variantes BA.2 omicron, qui montre ce qu’il appelle une résistance « extraordinaire » aux anticorps neutralisants produits par la vaccination et une infection antérieure. .

« Ce virus peut faire des choses inattendues », a-t-il déclaré. « Nous devons encore faire un bon travail de surveillance et garder un œil sur ces variantes émergentes préoccupantes. »

Ce travail a été soutenu par des fonds de donateurs anonymes, des subventions des National Institutes of Health, du National Center for Advancing Translational Sciences, de la bourse Glenn Barber de l’Ohio State’s College of Veterinary Medicine, du National Cancer Institute, du Robert J. Anthony Fund for Cardiovascular Research, et Comprehensive Cancer Center de l’Ohio State, Office of Health Sciences et Center for Clinical and Translational Science.

Les co-auteurs supplémentaires, tous de l’État de l’Ohio, sont Panke Qu, John Evans, Julia Faraone, Yi-Min Zheng, Claire Carlin, Mirela Anghelina, Patrick Stevens, Soledad Fernandez, Daniel Jones, Gerard Lozanski, Ashish Panchal, Linda Saif, Eugene Oltz et Richard Gumina.

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