TurboID découvre de nouvelles protéines méiotiques chez Arabidopsis thaliana

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Au cours de la méiose, le remaniement de l’information génétique entre les chromosomes homologues par recombinaison méiotique crée des gamètes variables et donc une variation génétique chez les descendants. La recombinaison méiotique se produit dans le contexte de l’axe chromosomique méiotique, une structure protéique le long de laquelle les chromatides sœurs sont disposées dans un réseau de base en boucle pendant la prophase I. Les données sur les organismes suggèrent que l’axe chromosomique méiotique sert d’échafaudage pour la recombinaison méiotique.

Dans l’usine modèle A. thaliana, les protéines associées à l’axe ASY1 et ASY3 sont essentielles pour la synapse et la recombinaison méiotique. « En raison du rôle clé des protéines d’axe telles que ASY1 et ASY3 pour la fidélité méiotique, y compris la fréquence et la distribution des croisements, des informations supplémentaires sur la composition et la régulation des axes chromosomiques méiotiques des plantes sont intéressantes », déclare le Dr Stefan Heckmann, responsable de l’IPK. groupe de recherche indépendant « Méiose ». Cependant, les études protéomiques végétales visant à disséquer la composition et la régulation des processus méiotiques, y compris les axes chromosomiques, sont entravées par un nombre limité de cellules méiotiques intégrées dans les organes floraux.

Plus récemment, l’identification de la biotine dépendante de la proximité (BioID) a permis l’identification d’« interactomes » protéiques proches. BioID est basé sur la fusion d’une protéine d’intérêt à une biotine ligase promiscuité qui catalyse la biotinylation des protéines à proximité. « Nous appliquons une version améliorée de BioID, appelée TbID, pour le marquage de proximité de l’axe chromosomique méiotique. Nous avons fusionné TbID aux protéines associées à l’axe ASY1 et ASY3 pour identifier leurs «interactomes» proches dans A. thaliana», déclare le Dr Stefan Heckmann. 39 candidats proches ASY1 et/ou ASY3 ont été identifiés. Outre les protéines connues liées à l’axe des chromosomes méiotiques, de nouvelles protéines jouant un rôle pendant la méiose ont également été découvertes.

« L’application réussie de TbID dans les cellules méiotiques suggère que la méthode employée pourrait être largement applicable aux types de cellules rares », déclare le Dr Chao Feng, premier auteur de l’étude. « Nous envisageons que les données favoriseront la recherche future sur les protéines candidates identifiées et que TbID pourrait être utilisé pour l’identification de protéines méiotiques ou de modifications encore inconnues. »

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