Carte macrogénétique globale des espèces marines formant des habitats : la diversité génétique est aussi une composante de la biodiversité

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Les espèces dites marines formatrices d’habitats – gorgones, coraux, algues, algues, phanérogames marins, etc. – sont des organismes qui participent à la génération et à la structuration des paysages sous-marins. Ce sont des refuges naturels pour d’autres espèces, et apportent de la biomasse et de la complexité aux fonds marins. Mais ces espèces clés des écosystèmes marins sont actuellement menacées par le changement climatique et d’autres perturbations dérivées de l’activité humaine. Maintenant, une étude publiée dans la revue Ecologie globale et biogéographie avertit que même dans les aires marines protégées (AMP), la diversité génétique des espèces structurelles n’est pas protégée, bien qu’elle soit essentielle pour la réponse et l’adaptation des populations aux changements qui modifient l’environnement naturel.

L’étude a été réalisée par Laura Figuerola-Ferrando, Cristina Linares, Ignasi Montero-Serra et Marta Pagès-Escolà, de la Faculté de biologie de l’Université de Barcelone et de l’Institut de recherche sur la biodiversité de l’UB (IRBio) ; Jean-Baptiste Ledoux et Aldo Barreiro, du Centre interdisciplinaire de recherche marine et environnementale (CIIMAR) au Portugal, et Joaquim Garrabou, de l’Institut des sciences marines (ICM-CSIC).

La diversité génétique est aussi une composante de la biodiversité

Traditionnellement, les plans de gestion et de conservation de la biodiversité marine ont pris en compte des facteurs tels que la richesse des espèces. La diversité génétique, autre composante majeure de la biodiversité, reflète la variation génétique qui existe entre les organismes d’une même espèce et est un facteur déterminant de la capacité d’adaptation des populations et de leur survie. Malgré son importance, la diversité génétique a jusqu’à présent été négligée dans les plans de gestion et de conservation.

« La diversité génétique joue un rôle clé dans l’amélioration de la capacité des espèces, des populations et des communautés à s’adapter aux changements environnementaux rapides résultant du changement climatique et ainsi à augmenter leur résilience », explique la chercheuse Laura Figuerola-Ferrando, première auteure de l’étude.

« Cependant, poursuit-elle, jusqu’à présent, la grande majorité des aires marines protégées sont mises en place en fonction de la présence de plusieurs espèces et habitats, sans tenir compte de leur diversité génétique. Un autre exemple serait la liste rouge de l’Union internationale pour la conservation of Nature (UICN), qui ne considère pas non plus la diversité génétique.

« Ces dernières années, la nécessité de concentrer les efforts de conservation sur la protection de la diversité génétique s’est renforcée. Les progrès technologiques dans le développement massif de différentes techniques pour déterminer la diversité génétique (par exemple, grâce à l’utilisation de microsatellites ou de petits fragments d’ADN), comme ainsi que leur coût abordable, peuvent aider à inclure la diversité génétique dans les plans de gestion et de conservation », explique le chercheur du Département de biologie évolutive, d’écologie et des sciences de l’environnement de l’UB.

De l’Atlantique nord-ouest au golfe de Guinée

L’étude applique des techniques macrogénétiques pour identifier les modèles génétiques généraux de diverses espèces marines à de grandes échelles spatiales. Les auteurs ont analysé les données d’une base de données mondiale contenant des informations sur la diversité génétique (basées sur des microsatellites) pour plus de 9 300 populations de 140 espèces dans différentes régions marines du monde.

Les résultats décrivent un scénario de référence des modèles génétiques des espèces marines formant des habitats (coraux, macroalgues, phanérogames marines, etc.) d’intérêt potentiel pour améliorer la gestion de la vie marine et les plans de conservation.

Les provinces du nord-ouest de l’Atlantique et la baie du Bengale sont les régions où la plus grande diversité génétique des espèces marines a été identifiée. Des valeurs assez élevées (supérieures à la moyenne mondiale) ont également été identifiées en Méditerranée. En revanche, les provinces marines présentant les valeurs de diversité génétique les plus faibles sont le golfe de Guinée et l’Atlantique sud-ouest.

Les résultats indiquent également une corrélation positive entre la diversité génétique et la richesse en espèces des espèces animales et végétales formant des habitats marins. Cependant, le document met en garde contre un résultat inquiétant : le Réseau des aires marines protégées (RAMP) dans les grandes écorégions océaniques ne préserve pas les zones où la diversité génétique des espèces formant des habitats marins est la plus élevée.

« Ce que nous avons vu, c’est que ce qui n’est pas protégé dans les AMP, c’est la diversité génétique. Dans l’étude, l’hypothèse initiale était qu’au sein de ces zones il y aurait une plus grande diversité génétique, mais cela n’a pas été le cas. En fait, nous avons vu, au niveau mondial, qu’il n’y a pas de différences de diversité génétique entre l’intérieur et l’extérieur des AMP », note Laura Figuerola-Ferrando, qui fait sa thèse de doctorat sous la direction de Cristina Linares (UB) et Joaquim Garrabou (ICM- SCCI).

Un nouveau modèle de biodiversité équatoriale aux pôles

Les auteurs ont également identifié un modèle spécifique dans la distribution de la diversité génétique des espèces formant l’habitat marin qui diffère des modèles traditionnels connus à ce jour. « Il s’agit d’un modèle latitudinal bimodal : c’est un modèle biogéographique complexe et cela implique que si nous modélisons comment la diversité génétique de ces espèces varie avec la latitude, nous trouvons deux pics dans les zones tempérées et une petite baisse de la diversité génétique à l’équateur,  » note la professeure ICREA Academia Cristina Linares (UB-IRBio), l’une des coordinatrices de l’étude avec Jean-Baptiste Ledoux (CIIMAR).

Cette découverte scientifique est pertinente car jusqu’à il y a quelques décennies, on considérait que la répartition de la biodiversité sur la planète suivait un schéma unimodal, c’est-à-dire qu’elle avait des valeurs maximales à l’équateur et décroissantes vers les pôles. « Ce n’est pas toujours le cas, notamment en termes de diversité des espèces dans les écosystèmes marins. Par exemple, dans le cas des espèces benthiques, ce modèle est biomodal plutôt qu’unimodal en termes de richesse en espèces et de diversité génétique », explique Cristina Linares.

« Dans notre étude, le modèle latitudinal bimodal est influencé par la taxonomie : dans le modèle utilisé, nous avons trouvé des différences statistiquement significatives entre les espèces animales (plus de diversité génétique) et les espèces végétales (moins de diversité génétique). De plus, si nous explorons le modèle latitudinal séparant espèces animales et végétales, on constate qu’un schéma bimodal continue d’être observé chez les animaux, mais on ne peut pas en dire autant des plantes », ajoute le chercheur Jean-Baptiste Ledoux (CIIMAR).

Diversité génétique : améliorer les plans de gestion de la conservation

Les conclusions des travaux rappellent la nécessité d’inclure la diversité génétique des populations dans les plans de gestion et de conservation de la biodiversité de la planète. « L’importance de la diversité génétique dans les plans de gestion et de conservation de la biodiversité vient d’être renforcée avec le ‘Kunming-Montréal Global Biodiversity Framework’ au sein de la Convention sur la diversité biologique (CBD/COP/15/L25, 2022). Dans ce contexte, nous pensons que le référentiel sur les patrons de diversité génétique des espèces marines formant des habitats définis comme notre travail peut être très pertinent », note Jean-Baptiste Ledoux.

Cette étude révèle également que les régions méditerranéenne et atlantique sont parmi les plus présentes dans la littérature scientifique utilisée dans ce travail sur les patrons macrogénétiques des espèces structurelles profondes.

« En revanche, si on regarde les taxons analysés, on voit que la mer Méditerranée est la province marine où l’on a des études de taxons plus différents (octocoraux, hexacoraux, éponges, phanérogames marins et algues). Dans l’Atlantique nord il y a est également assez varié de taxons (principalement des algues, des phanérogames marins, mais aussi des hexacoraux, des octocoraux, des bryozoaires et des éponges). En revanche, dans l’Atlantique sud, les études se concentrent principalement sur les algues », concluent les chercheurs.

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