L’origine surprenante d’une infection mortelle à l’hôpital

Le personnel hospitalier consacre beaucoup de temps à protéger les patients contre les infections pendant qu’ils sont soignés à l’hôpital. Ils emploient diverses méthodes allant de l’hygiène des mains aux chambres d’isolement en passant par un assainissement environnemental rigoureux. Malgré ces efforts, des infections à l’hôpital surviennent encore, la plus courante étant causée par la bactérie. Clostridioides difficileou C. diff, responsable de près d’un demi-million d’infections aux États-Unis chaque année.

Résultats surprenants d’une nouvelle étude menée Médecine naturelle suggèrent que le fardeau de l’infection à C. diff pourrait être moins une question de transmission hospitalière que le résultat de caractéristiques associées aux patients eux-mêmes.

L’équipe d’étude, dirigée par Evan Snitkin, Ph.D. et Vincent Young, MD, Ph.D., tous deux membres des départements de microbiologie et d’immunologie et de médecine interne/maladies infectieuses de la faculté de médecine de l’Université du Michigan, et Mary Hayden, MD du Rush University Medical Center, ont tiré parti des études épidémiologiques en cours axées sur les hôpitaux. -infections acquises qui leur ont permis d’analyser quotidiennement des échantillons fécaux de chaque patient de l’unité de soins intensifs du Rush University Medical Center sur une période de neuf mois.

Arianna Miles-Jay, boursière postdoctorale dans le laboratoire du Dr Snitkin, a analysé plus de 1 100 patients participant à l’étude et a découvert qu’un peu plus de 9 % étaient colonisés par C. diff. Utilisation du séquençage du génome entier à UM de 425 C. difficile souches isolées de près de 4 000 échantillons fécaux, elle a comparé les souches entre elles pour analyser leur propagation.

« En cultivant systématiquement chaque patient, nous pensions pouvoir comprendre comment se produisait la transmission. La surprise a été que, sur la base de la génomique, il y avait très peu de transmission. »

Essentiellement, il y avait très peu de preuves que les souches de C. diff d’un patient à l’autre étaient les mêmes, ce qui impliquerait une acquisition à l’hôpital. En fait, il n’y a eu que six transmissions génomiques au cours de la période d’étude. Au lieu de cela, les personnes déjà colonisées couraient un plus grand risque de passer à l’infection.

« Quelque chose est arrivé à ces patients que nous ne comprenons toujours pas et qui a déclenché la transition du C. diff présent dans l’intestin à l’organisme provoquant la diarrhée et les autres complications résultant de l’infection », a déclaré Snitkin.

Hayden note que cela ne signifie pas que les mesures de prévention des infections en milieu hospitalier ne sont pas nécessaires. En fait, les mesures en place dans l’unité de soins intensifs Rush au moment de l’étude – taux élevés de respect de l’hygiène des mains par le personnel de santé, désinfection systématique de l’environnement avec un agent actif contre le C diff et chambres pour patients individuels – en étaient probablement responsables. pour le faible taux de transmission. L’étude actuelle souligne cependant que des mesures supplémentaires sont nécessaires pour identifier les patients colonisés et tenter de prévenir leur infection.

D’où vient le C. diff ? « Ils sont en quelque sorte tout autour de nous », a déclaré Young. « C. diff crée des spores, qui sont assez résistantes aux stress environnementaux, notamment l’exposition à l’oxygène et la déshydratation… par exemple, elles sont imperméables au désinfectant pour les mains à base d’alcool. »

Cependant, seulement environ 5 % de la population en dehors d’un établissement de soins de santé a C. diff dans l’intestin – où cela ne pose généralement aucun problème.

« Nous devons trouver des moyens d’empêcher les patients de développer une infection lorsque nous leur donnons des aliments par sonde, des antibiotiques, des inhibiteurs de la pompe à protons – toutes choses qui prédisposent les gens à contracter une véritable infection à C. diff qui provoque des dommages aux intestins ou pire. « , a déclaré Young.

L’équipe espère ensuite s’appuyer sur les travaux portant sur l’utilisation de modèles d’IA pour prédire les patients à risque d’infection à C. diff afin d’identifier les patients susceptibles d’être colonisés et qui pourraient bénéficier d’une intervention plus ciblée.

Snitkin a déclaré : « De nombreuses ressources sont consacrées à de nouvelles améliorations dans la prévention de la propagation des infections, alors qu’il existe un soutien croissant pour réorienter certaines de ces ressources afin d’optimiser l’utilisation des antibiotiques et d’identifier d’autres déclencheurs qui conduisent les patients porteurs de C diff et d’autres. pathogènes des soins de santé pour développer des infections graves.

Les autres auteurs incluent Arianna Miles-Jay, Michael Y. Lin, Teppei Shimasaki, Michael Schoeny, Christine Fukuda, Thelma Dangana, Nicholas Moore, Sarah E. Sansom, Rachel D. Yelin, Pamela Bell, Krishna Rao, Micah Keidan, Alexandra Standke, et Christine Bassis.

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